Не будет преувеличением сказать, что метод редактирования генов CRISPR-Cas9 стал революционным прорывом, позволив ученым быстро, легко и точно редактировать участки ДНК. Но вопросы о том, насколько точен инструмент CRISPR, были подняты в новом исследовании Медицинского центра Колумбийского университета, которое показывает, что эта технология редактирования генов может внести в геном сотни непреднамеренных мутаций.
CRISPR вызвал поток новых исследований во всем мире, от нацеленный на рак в ВИЧ, С первые испытания на людях с участием отредактированных CRISPR ячеек, которые уже ведутся в Китае, и испытания в США, намеченного на 2018. Но это новое исследование призывает к осторожности, продвигаясь вперед, предполагая, что нам еще предстоит понять большие геномные эффекты инструмента.
Команда ученых, участвовавших в исследовании, ранее работала с инструментом CRISPR, чтобы лечить серьезное заболевание глаз называется пигментным ретинитом, что приводит к слепоте. Они решили исследовать весь геном CRISPR-обработанных мышей из своих предыдущих экспериментов, чтобы найти возможные мутации, даже те, которые изменили только один нуклеотид.
Как правило, когда ученые пытаются определить, привело ли редактирование CRISPR к мутации или удалению за пределами цели, они используют компьютерные алгоритмы, чтобы определить области, которые могут быть затронуты наиболее вероятно, и сосредоточить свое внимание на них.
«Эти прогностические алгоритмы, кажется, хорошо справляются со своей задачей, когда CRISPR применяется в клетках или тканях в чашке, - говорит соавтор исследования, профессор Александр Басюк, - но полногеномное секвенирование не использовалось для поиска всех отклонений. целевые эффекты у живых животных ».
При исследовании всего генома у мышей, обработанных CRISPR, они обнаружили, что инструмент успешно исправил специфический ген, на который они нацелены, но он также потенциально вызвал множество других генетических изменений. У двух животных, обработанных CRISPR, было выявлено более чем делеции или инсерции больших генов 100 и более однонуклеотидных мутаций 1,500.
Разместил это на форуме рядом со статьей о том, как использовать CRSPR для производства флуоресцентного пива.